MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 18491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009925	AATA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009925	ATGA	2	8	39	46	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009925	ATTT	2	8	209	216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009925	TA	3	6	229	234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009925	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009925	AAT	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009925	CAT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009925	AAC	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009925	ATTAA	2	10	580	589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009925	AGT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009925	ACC	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009925	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009925	TGT	3	9	732	740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009925	TTG	2	6	755	760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009925	TTG	2	6	794	799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009925	CCG	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009925	TGTC	2	8	824	831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009925	GGT	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009925	TCA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009925	TCG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009925	GGTA	2	8	963	970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009925	TTG	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009925	GAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009925	CGG	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009925	GCA	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009925	CGA	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009925	TTG	2	6	1150	1155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009925	GGAT	2	8	1181	1188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009925	AGT	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009925	AAC	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009925	GGTTA	2	10	1366	1375	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009925	TGT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009925	TCT	2	6	1509	1514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009925	AT	3	6	1583	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009925	GCT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009925	ATG	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009925	TG	3	6	7106	7111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009925	GCT	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009925	AAT	2	6	7146	7151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009925	T	7	7	7164	7170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009925	T	8	8	7234	7241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009925	AGG	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009925	GGT	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009925	CGC	2	6	10202	10207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009925	CTTT	2	8	10391	10398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009925	AAAC	2	8	12793	12800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009925	TCAG	2	8	12834	12841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009925	TTC	2	6	12873	12878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009925	TC	3	6	14065	14070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009925	TC	3	6	14087	14092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009925	CCA	2	6	16403	16408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009925	GTC	2	6	16417	16422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009925	TTTA	2	8	19235	19242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009925	AAT	2	6	19262	19267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009925	GAACA	2	10	19278	19287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009925	ATT	2	6	19292	19297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009925	ATT	2	6	19309	19314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009925	AGAA	2	8	19344	19351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009925	ACA	2	6	19371	19376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009925	AG	3	6	19508	19513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009925	CAG	2	6	21808	21813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009925	TGGG	2	8	21831	21838	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009925	TGC	2	6	21888	21893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009925	AGC	2	6	21921	21926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009925	TTC	2	6	22396	22401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009925	CAA	2	6	22419	22424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009925	A	6	6	22519	22524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009925	TCAC	2	8	22526	22533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009925	AAAAGT	2	12	27106	27117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009925	TTG	2	6	27191	27196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009925	ATC	2	6	27260	27265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009925	TTG	2	6	27350	27355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009925	AG	3	6	27366	27371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009925	TGTC	2	8	28525	28532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009925	GAA	2	6	29388	29393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009925	TGA	2	6	29403	29408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009925	GAA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009925	ATAC	2	8	30939	30946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009925	AT	3	6	31730	31735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009925	TAAATT	2	12	31782	31793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009925	G	6	6	31858	31863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009925	GT	3	6	34765	34770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009925	AGA	2	6	34814	34819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009925	T	7	7	34960	34966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009925	TA	3	6	35028	35033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009925	CAT	2	6	35048	35053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009925	GTT	2	6	35062	35067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009925	CCT	2	6	35120	35125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009925	CGT	2	6	37012	37017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009925	CAG	2	6	37027	37032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009925	CCA	2	6	37621	37626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009925	A	6	6	37687	37692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009925	AG	4	8	39399	39406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009925	TGGA	2	8	39411	39418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009925	ATAC	2	8	39454	39461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009925	GAA	2	6	39481	39486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009925	TC	4	8	39525	39532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009925	CAA	2	6	39550	39555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009925	A	6	6	40842	40847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009925	GAT	2	6	40860	40865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009925	CCG	2	6	40950	40955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009925	ACA	2	6	40960	40965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009925	CAT	2	6	40967	40972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009925	GTCT	2	8	41151	41158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009925	ACG	2	6	41293	41298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009925	T	6	6	41329	41334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009925	TAAA	2	8	43229	43236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009925	AATC	2	8	43359	43366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009925	GAACA	2	10	43569	43578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009925	TCA	3	9	43735	43743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009925	TCC	2	6	43745	43750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009925	TA	3	6	45510	45515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009925	T	7	7	45802	45808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009925	ATA	2	6	45866	45871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009925	GTTA	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009925	GA	4	8	46401	46408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009925	TCT	2	6	46424	46429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009925	ACA	2	6	46439	46444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009925	CTT	2	6	46980	46985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009925	AAT	2	6	47015	47020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009925	ATGA	2	8	47039	47046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009925	ATTT	2	8	47094	47101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009925	TCA	2	6	47106	47111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009925	TAAA	2	8	47112	47119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009925	CAT	2	6	47183	47188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009925	GAAC	2	8	47199	47206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009925	GT	3	6	49706	49711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009925	TGAA	2	8	49741	49748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009925	CTAT	2	8	50567	50574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009925	CAG	2	6	50621	50626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009925	TTC	2	6	50638	50643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009925	GAA	2	6	50672	50677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009925	TAA	2	6	50996	51001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009925	TATT	2	8	51057	51064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009925	ATT	2	6	51080	51085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009925	ATT	2	6	51104	51109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009925	AACA	2	8	51134	51141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009925	ATTT	2	8	51164	51171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009925	TA	3	6	51955	51960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009925	T	6	6	52017	52022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009925	CAAT	2	8	52056	52063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009925	AATC	2	8	52132	52139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009925	TCA	2	6	52188	52193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009925	ATC	2	6	52256	52261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009925	TCT	2	6	52284	52289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009925	TAA	2	6	52310	52315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009925	GA	3	6	52648	52653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009925	TTC	2	6	52700	52705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009925	A	7	7	52721	52727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009925	CGT	2	6	52730	52735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009925	AGC	2	6	52767	52772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009925	TAT	2	6	52796	52801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009925	ACC	2	6	55925	55930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_009925	CTAG	2	8	56665	56672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009925	CAA	2	6	56694	56699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_009925	ACA	2	6	56709	56714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_009925	AC	3	6	56727	56732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_009925	TGC	2	6	57688	57693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009925	ACC	2	6	57721	57726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_009925	GAG	2	6	58679	58684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009925	CAA	2	6	58717	58722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_009925	GCTTGA	2	12	58906	58917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_009925	GCA	2	6	58928	58933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_009925	TGAC	2	8	60446	60453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_009925	ACC	2	6	60552	60557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_009925	TCCA	2	8	60843	60850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_009925	ACT	2	6	60949	60954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_009925	CTATTC	2	12	62438	62449	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_009925	CA	3	6	63268	63273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_009925	TTTA	2	8	65190	65197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_009925	TGA	2	6	65272	65277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009925	AGTG	2	8	65306	65313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_009925	GTA	2	6	70188	70193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009925	CTTA	2	8	70374	70381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_009925	TCTT	2	8	71517	71524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_009925	TCAA	2	8	73174	73181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_009925	AAGAT	2	10	73246	73255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009925	A	6	6	73308	73313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009925	A	6	6	73334	73339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009925	CAA	2	6	73352	73357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_009925	AG	3	6	81053	81058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009925	AGA	2	6	81084	81089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009925	TA	3	6	81107	81112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009925	ATT	2	6	81188	81193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009925	TAG	2	6	81195	81200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_009925	T	6	6	109850	109855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009925	T	6	6	109883	109888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009925	T	6	6	109957	109962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009925	TGAG	2	8	110026	110033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_009925	GCT	3	9	115282	115290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009925	TA	3	6	116997	117002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009925	CAA	2	6	117087	117092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_009925	TTGA	2	8	117125	117132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009925	CTA	2	6	117152	117157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_009925	T	6	6	117215	117220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009925	GA	3	6	117244	117249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009925	GTTT	2	8	117293	117300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009925	CG	3	6	118826	118831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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293	NC_009925	CGT	2	6	118914	118919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_009925	CT	3	6	158920	158925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
423	NC_009925	GAC	2	6	158954	158959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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